R言語
datasetsというパッケージが最初から読み込まれている。 > data() 別ウィンドウで表示。 library(help = "datasets") でも同じ。一覧が出るんで、名前を選ぶとデータが出る。 > Titanic データはデータフレーム、テーブル、マトリックスなど。後は適当に処理…
整数値を表すのにLを使う。なんでLだ？ とは誰でも思うだろう。 http://stackoverflow.com/questions/24350733/why-would-r-use-the-l-suffix-to-denote-an-integer
「2つの変数の相関は？」というとき、2つの変数の値が同じ空間で、定義域（個体識別子の集合）も同じなら、同じベクトル空間内で角度を測るので意味を持つが、身長と体重の相関とか年齢と体力の相関とか、どう考えるのだ？ 異なる2つのユークリッドベクトル…
データフレームで、df[i, ] でi番目の個体（あるいは観測）のタプルが得られる。このタプル（ベクトル変数の具現値）をベクトル空間の要素と見てよいが、df[ , k] もベクトルと見る必要がある。df[ , k]はRのデータ構造としてもベクトルだが、意味的にもベク…
後で確認してみるが、とりあえずメモ。先に、z-w空間内での計算 [P1, P2] = [(z1, w1), (z2, w2)] として、次の方程式を解く。 w2 + t*(w2 - w1) = 0 t = w1/(w1 - w2) s = z1 + (w1/(w1 - w2))*(z2 - z1)話は前後するが、座標変換の行列Tを定義する。 Tの成…
スカラーがない。長さ1のベクトルしかない。 とにかくリテラルがない。ベクトルでさえリテラルで書けない。キツイ。 ミュータブルなオブジェクトがない。S4, R5, R6か？ 構造体的データがない。listで代用 行列の折り返し方向が逆（列優先） データフレーム…
stat_bin <- function ( mapping = NULL, data = NULL, geom = "bar", position = "stack", width = 0.9, drop = FALSE, right = FALSE, binwidth = NULL, origin = NULL, breaks = NULL, ... ) { StatBin$new( mapping = mapping, data = data, geom = geom…
確認 .Library path.package() search() loadedNamespaces() library() packageVersion(名前) libray(helpe="名前"), help(package="名前") example(名前) vignette(名前) browseVignettes(名前) インストールと更新 istall.packages(名前) install.packages…
grid.rect(3/4, 5/8, 0.5, 0.25, gp=gpar(fill="pink")) grid.rect(3/4, 7/8, 0.5, 0.25, gp=gpar(fill="skyblue")) grid.grill() grid.lines( c(0.0, 1.0), c(0.5, 0.5)) grid.lines( c(0.5, 0.5), c(0.0, 1.0))
ggplot2の原理と機能性は素晴らしいが、ライブラリの作りとしては「どうなの」な点がある。モジュラー／コンポネント的に作ってあるのだけど、部品を単独で利用したり、部品の処理だけを確認することが出来ない。再利用可能部品もあるのに、隠蔽して閉じ込め…
ggplot2のlayer関数、以下がすべて。 Create a new layer Description Create a new layer Usage layer(...)他の関数のリファレンスからlayerが参照されている（ブラケットで表記）。layerへのリンクをたどったときのガッカリ感は半端ない。 Usage geom_poin…
こういうの(↓)がけっこう多い。情報量ゼロに近い。Rのgridパッケージの凄まじい座標系 - 檜山正幸のキマイラ飼育記 メモ編 も参照。 Description an ellipse grob Usage ellipseGrob(x, y, size = 1, angle = rep(pi/2, length(x)), ar = 1, gp = gpar(colou…
(setq ess-default-style 'DEFAULT) (ess-toggle-underscore nil) (setq ess-fancy-comments nil)
簡易版・ボレルのパラドックスとその解釈：R言語を使って - 檜山正幸のキマイラ飼育記 で使った、gridによる描画。 # target-disk # grid.circle(x=0.5, y=0.5, r=0.5, gp=gpar(fill="skyblue")) grid.circle(x=0.5, y=0.5, r=0.5/3, gp=gpar(fill="red")) #…
ひどい話だ。 S3 S4 R5 proto typeof(x) 多くは"list" "S4" "S4" "environment" class(x) S3クラス名 S4クラス名 R5クラス名 "proto", "environment" attributes(x) 普通 オブジェクト構造 普通 classだけ names(x) メンバー列挙 NULL NULL NULL ls(x) メン…
ggplot2内でprotoを使っているが、protoの有効範囲はggplot2の名前空間内に閉じ込められているようだ。require(proto)すると事情が違ってくる。protoパッケージをロードしている状態だと、protoオブジェクトxに対して x$class()関数が使えるようになる。仮想…
ggplotオブジェクト： S3クラスのオブジェクト。実体はリスト。メンバー列挙はnames(p)、メンバアクセスは p$m layerオブジェクト： protoオブジェクト。実体は環境（environment）。メンバー列挙はls(lay)、メンバアクセスは lay$m statオブジェクト： prot…
プロットオブジェクトのscalesメンバーには、S4オブジェクト（への参照）が入っている。 S4オブジェクトのさらにscalesメンバーがあって、これはリスト。 それとは別にS3システムで書かれたscale_*関数群がある。 かなり混乱している。色々とツギハギな感じ…
ggplotオブジェクト： S3クラスのオブジェクト。実体はリスト。メンバー列挙はnames(p)、メンバアクセスは p$m layerオブジェクト： protoオブジェクト。実体は環境（environment）。メンバー列挙はls(lay)、メンバアクセスは lay$m statオブジェクト： prot…
showViewport(), showGrob()がイマイチわからない。戻す方法も分からない。gridTree()は元のウィンドウが消えてしまう。複数のウィンドウがあるとうまくいかないみたいだし。なんか役に立たない。
シーン（graphical scene）：ビューポートとグロブからなるツリー・データ構造 ページ： 描画が実行される物理デバイス。dev.* で制御する。配置されたピクセルの集合。 ビューポート： 入れ子の親子関係を持てる矩形領域。ROOT以外は親ビューポートを持つ。…
初めてbioconductorのライブラリをインストールした。 source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("Rgraphviz") これで済む。biocLiteという関数を使うわけだ。簡単だ。入れたパッケージは、Rgraphviz。 http://www.bioconductor.org/packages/…
Rのgridパッケージの凄まじい座標系 - 檜山正幸のキマイラ飼育記 メモ編 のような座標系で： library(grid) # 横幅は半分、高さは8割のビューポートを作って使う vp <- viewport(x=0.5, y=0.5, width=0.5, height=0.8) pushViewport(vp) # ビューポートに枠…
デバイス矩形（ウィンドウの描画領域）とビューポート矩形（仮想的な四角）がある。いかなる場合でもデバイス矩形の座標値の範囲は 0≦x≦1, 0≦y≦1。これは矩形が正方形であることを意味しない。矩形の物理的なアスペクト比にあうように伸縮される。つまり、座…
